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水体富营养化不仅影响水资源的利用、渔业的发展，而且会刺激有害藻类的暴发，使水域丧失生态功能和价值。同时，水体富营养化还给人们的生活和经济带来极大的危害和损失。相关调查表明，我国湖泊、水库富营养化的比例分别为77.00%、30.80%，湖泊富营养化成为我国严重的水环境问题之一。
沉水植物作为初级生产者，在水生态系统中起着重要作用，重建沉水植物群落结构被认为是修复富营养化水体的有效手段。我国富营养化浅水湖泊成功修复的案例以惠州西湖和太湖五里湖为典型。
当缺乏沉水植物时，浮游动物的种群密度处于较低水平(15%~20%时，浮游甲壳类动物生物量处于较高水平，且体型较大的个体居多 。由此可见，沉水植物群落在一定程度上可保证浮游动物的种群数量，实现对浮游植物的控制，有利于维持湖泊的清水状态。
沉水植物的生态效应机理
不同营养级的上行效应(Bottom-up Effect)和下行效应(Top-down Effect)相结合维持着生态系统群落结构的稳定。沉水植物对无机环境的影响以及与其他生物之间的相互作用(图1)保证了生态系统中上行效应和下行效应及其他级联效应的正常发挥 。
沉水植物对营养盐的吸收和钝化抑制上行效应对浮游植物的促进作用，降低水华暴发的可能性。另外，沉水植物群落结构促进肉食性鱼类生长，保证生态系统中下行效应的发挥，即肉食性鱼类捕食草食性鱼类、浮游生物鱼类，优化鱼类种群结构，降低沉水植物、浮游动物被大量捕食的压力，达到控制浮游植物的效果(图2)。湖泊生态系统上行效应(通过营养盐)-下行效应(通过摄食)和其他效应模式
影响沉水植物恢复的因子
① 藻类的限制
富营养化湖泊的初级生产力通常以浮游植物为主，呈现浊水态。藻类的遮阴效应、营养盐和无机盐的竞争作用会阻碍沉水植物的生长以及在水域中的空间分布。
在环境变化和人类活动的影响下，我国大部分湖泊生态环境恶化，沉水植物的分布面积萎缩，群落结构趋向单一化。沉水植物的消失，使生态系统中食物链变短，食物网简化，物种多样性降低，从而使整个生态系统变得较为脆弱。
近年来，湖泊富营养化问题受到了全世界湖沼及环境学的广泛关注。随着人类活动对湖泊生态系统影响的加剧，湖泊大型水生植物逐渐减少，甚至消失。恢复大型水生植被成为富营养化浅水湖泊生态修复的主要内容之一，是近年来水体修复生态技术研究的热点之一(种云霄，2003 )。